L’équipe BAOBAB-ERABLE implique 38 chercheurs (en incluant les membres externes), post-docs, doctorants et ingénieurs. L’équipe a des intérêts généraux en biologie computationnelle et propose des algorithmes chaîne (séquence)/arbre/graphe et des modèles pour l’analyse computationnelle en particulier mais pas exclusivement de symbiose. Le responsable d’équipe, Marie-France Sagot a reçu une bourse européenne (ERC Advanced Grant) (2010-2015), SISYPHE, pour travailler sur ce thème. L’équipe est aussi partenaire de 2 projets européennes, le FP7 KBBE, BacHBerry, et le H2020-MSCA-ETN, MicroWine. Depuis le recrutement de Vincent Lacroix en tant que professeur associé en 2009, l’équipe s’investit aussi fortement dans le développement de méthodes pour l’analyse de données NGS qui est au coeur d’un projet financé par l’ANR, Colibread, porté par Pierre Peterlongo (équipe GenScale de l’Inria de Rennes), d’une bourse Inserm, Exomic, de Didier Auboeuf (Inserm Lyon) et d’un projet d’Investissement d’Avenir, ABS4NGS, porté par Emmanuel Barillot. L’équipe est aussi à la tête d’un laboratoire international associé, LIRIO avec le Brésil et d’une équipe associée Inria, ALEGRIA, aussi avec le Brésil (Instituto de Biologia Molecular do Paraná – Fiocruz-PR, Paraná). De plus, l’équipe est associée au Pôle Rhône-Alpin de Bio-informatique (PRABI), à la plate-forme IBISA et est membre du réseau RENABI.

Mots clés : Algorithmes, Combinatoire, Génomique, Réseaux, NGS, Symbiose, Biologie computationnelle, Complexité, Statistiques