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Bioinformatique, Phylogénie et Génomique Evolutive

UMR 5558

Adresse : 
Laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive (LBBE)
Mél : 
celine.brochier-armanet@univ-lyon1.fr
Tutelle : 
UCBL, CNRS, INRIA, VetAgro Sup

Organisation

Responsable d'équipe : Céline Brochier-Armanet

Axe(s) de recherche

L’équipe Bioinformatique, Phylogénie et Génomique Evolutive étudie la génomique comparative et développe des méthodes bio-informatiques variées : phylogénie moléculaire, génomique comparative, reconstruction de séquences ancestrales, outils statistiques pour les données de NGS. Nos principaux thèmes de recherche sont :
- l’analyse des conséquences évolutives des mécanismes de mutation et de réplication : impact des recombinaisons génétiques sur l’évolution du génome, l’origine et l’évolution des chromosomes sexuels, l’évolution de la composition en bases.
- la phylogénie moléculaire des bactéries et archées et les développements méthodologiques pour la reconstruction phylogénétique.
- l’analyse spatio-temporelle de la diversité microbienne.
- l’évolution des répertoires de gènes : conséquences de la duplication génétique, détection du transfert horizontal de gènes, évolution de la modularité protéique.


Mots clés : Biologie évolutive, Génomique comparative, Modélisation, Bioinformatique, Phylogénie
 
 

Domaines

Biologie évolutive
Génomique comparative
Modélisation
Phylogénie

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