L’équipe administrative est placée sous la responsabilité des deux co-directeurs du LabEx. Son rôle est de faciliter la mise en place et la structuration d’ECOFECT, de garantir un bon échange entre les équipes, et de veiller à la bonne gestion des projets menés.

Elle gère les liens avec les entreprises privées à des fins de valorisation, ainsi qu’avec les acteurs locaux, dont l'IRT BioAster.

Elle est composée des deux co-directeurs, Dominique Pontier et François-Loïc Cosset et de la Chef de projet, Isabelle Weiss.