L’axe 2 s’intéressera aux mécanismes et à l’épidémiologie des multi-infections. Les multi-infections sont la règle, mais ce contexte n’est pas encore complètement pris en compte dans la gestion des maladies infectieuses. Ainsi, les premiers défis dans ce cadre seront le décryptage des mécanismes moléculaires et cellulaires régissant les interactions entre agents, permettant de comprendre les effets synergiques ou antagonistes de leurs relations, ou encore la dynamique d’émergence des résistances dans un contexte multiparasitaire.

Deux grandes thématiques de recherche :
 

Ces interactions seront étudiées dans des environnements de complexité variable et notamment en milieu hospitalier, un environnement intermédiaire entre les conditions naturelles et celles de laboratoire très contrôlées.